工具 | 如何在Python中调用R语言包？

如何安装rpy2？

首先需要安装Python的科学计算环境Anaconda和R软件（最好再安装个Rstudio，好用到爆的R软件IDE，安装和管理R包太方便了），安装好Anaconda和R软件后，在系统的命令提示符里输入：

conda install -c r rpy2=2.8.5

我这里已经安装好了，如下：

这里是用Anaconda的conda install方法安装Python包，可不要小看了这个安装方法，如果用pip install rpy2、easy install rpy2或者把rpy2包下载到本地使用python setup.py install方法安装rpy2包可就各种出错啦！！有人好受的……conda install这个方法作者找了很久，至少百度上介绍的所有安装rpy2的方法基本都会或多或少地报错。

加载rpy2与rpy2包的内容

rpy2，可以实现使用python读取R的对象、调用R的方法以及Python与R数据结构转换等。

（1）加载rpy2

rpy2包里面包含下面的内容：

我们使用最多的就是robjects这个高水平交互的方法。

如何使用ry2

（1）在Python中加载R软件包

需要用到robjects中的packages里面的importr函数，我们以R中的stats包和ggplot2包为例，ggplot2是R中超级强大的绘图包。当然，需要先在R软件中加载这两个包。

（2）访问R实例

需要用到robjects.r，它是在Python中的嵌入式R进程，把r当作从python走向R的通道来看就可以了。通过r实例，我们可以读取R的内置变量、调用R的函数、甚至，直接把它当作R的解析器来用。

上面用了三种方式来访问R对象中的pi，分别把r实例当作字典，把r实例当作方法，把r实例当作一个类对象。

还可以用过R实例，直接在Python中写R代码：

总之用robjects.r(‘ ‘)，括号里面可以直接敲R的代码就是了！！

（3）利用robjects创建R向量

创建R的字符型、整形和浮点型向量

（4）调用R函数

利用robjects.r(‘ ‘)调用R中的函数，以sum求和函数和sort排序函数为例

（5）调用R语言绘图

example1：

得到下面的结果：

example2:利用R的ggplot2包绘图

得到如下结果：

（6）调用R的stats包进行方差分析

得到如下结果：

总结

本文主要介绍了利用rpy2包在Python中访问R语言包和函数，其中最重要的子包是robjects，可以生成R中的数据结构；最重要的实例是rojects.r(‘ ‘)，可以通过三种方式访问R中的数据和函数，甚至可以利用其在Python中进行R编程；最重要的函数是importr(‘ ‘)，它可以加载所有R语言中安装的包。在Python中使用R语言的包还有很多，rpy2只是其中一个，这就是开源软件的强大之处啊！